ยาต้านมาเลเรียมีหลายประเภท และการเลือกใช้ยาขึ้นอยู่กับปัจจัยต่างๆ เช่น ชนิดของปรสิตพลาสโมเดียมที่ทำให้เกิดการติดเชื้อ ความรุนแรงของโรค และภูมิภาคทางภูมิศาสตร์ที่เกิดการติดเชื้อ ต่อไปนี้เป็นยาต้านมาเลเรียประเภททั่วไปบางประเภท

• คลอโรควิน: ครั้งหนึ่งคลอโรควินเคยใช้กันอย่างแพร่หลายในการรักษาและป้องกันโรคมาลาเรีย แต่ประสิทธิผลของคลอโรควินลดลงในหลายภูมิภาคเนื่องจากมีการพัฒนาสายพันธุ์ที่ดื้อยาของปรสิตมาลาเรีย
• การบำบัดแบบผสมผสานระหว่างอาร์เทมิซินินและอาร์เทมิซินิน (ACTs): อาร์เทมิซินินได้มาจากพืชบอระเพ็ดหวานและมีประสิทธิภาพสูงในการป้องกันโรคมาลาเรีย มักใช้ร่วมกับยาต้านมาเลเรียชนิดอื่นเพื่อลดความเสี่ยงของการดื้อยา ACTs ถือเป็นแนวทางแรกในการรักษาโรคมาลาเรียที่ไม่ซับซ้อนในหลายส่วนของโลก